Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SH3BGRP55822 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms