Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD23AP54725 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms