Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ETV1P50549 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ETV1P50549 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ETV1P50549 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms