Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPAP49450 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPAP49450 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPAP49450 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CENPAP49450 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPAP49450 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms