Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK8P49336 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK8P49336 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK8P49336 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK8P49336 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK8P49336 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK8P49336 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK8P49336 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK8P49336 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms