Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA8P48165 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA8P48165 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA8P48165 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA8P48165 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms