Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 NUR1YDL089W 1455 nt1.37□□□□□ -2.19
CCS1P40202 TRZ1YKR079C 2517 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 SSF1YHR066W 1362 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 TRM3YDL112W 4311 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 SNA4YDL123W 423 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 NCB2YDR397C 441 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YER046W-AYER046W-A 330 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 PGD1YGL025C 1194 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YGL118CYGL118C 438 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 ECI1YLR284C 843 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 SGT1YOR057W 1188 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 PKH3YDR466W 2697 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YJL070CYJL070C 2667 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 PIG2YIL045W 1617 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 PES4YFR023W 1836 nt1.36□□□□□ -2.19
CCS1P40202 BRR2YER172C 6492 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 BI3Q0115 1554 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YCR099CYCR099C 468 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 SHR3YDL212W 633 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 ATP17YDR377W 306 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 LSM4YER112W 564 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 FYV4YHR059W 393 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 PPE1YHR075C 1203 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 RPF2YKR081C 1035 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 SYM1YLR251W 594 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 MRPL44YMR225C 297 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 RRT16YNL105W 429 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 CAT2YML042W 2013 nt1.35□□□□□ -2.19
CCS1P40202 HSE1YHL002W 1359 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 DAL5YJR152W 1632 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YCR090CYCR090C 549 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 VAB2YEL005C 849 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 CAJ1YER048C 1176 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YGL024WYGL024W 336 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 CTK2YJL006C 972 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YPT52YKR014C 705 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 GSP1YLR293C 660 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YOL118CYOL118C 309 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YBR292CYBR292C 372 nt1.34□□□□□ -2.19
CCS1P40202 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.34□□□□□ -2.2
CCS1P40202 PRK1YIL095W 2433 nt1.34□□□□□ -2.2
CCS1P40202 ESC2YDR363W 1371 nt1.34□□□□□ -2.2
CCS1P40202 CST9YLR394W 1449 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 RBK1YCR036W 1002 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 ATG16YMR159C 453 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SRL4YPL033C 846 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YBR090CYBR090C 369 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 RKM1YPL208W 1752 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YBP1YBR216C 2025 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SLM1YIL105C 2061 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 REV3YPL167C 4515 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 CAT8YMR280C 4302 nt1.33□□□□□ -2.2
CCS1P40202 HCS1YKL017C 2052 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 PIK1YNL267W 3201 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 UBC9YDL064W 474 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 UBC5YDR059C 447 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 TVP15YDR100W 432 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 CAP1YKL007W 807 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 TPK3YKL166C 1197 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 CCW14YLR390W-A 717 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 LSM2YBL026W 288 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 COA6YMR244C-A 315 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YIP3YNL044W 531 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 ATX1YNL259C 222 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 RTT107YHR154W 3213 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SOK2YMR016C 2358 nt1.32□□□□□ -2.2
CCS1P40202 NIC96YFR002W 2520 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 CDC37YDR168W 1521 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 PSO2YMR137C 1986 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 RPN9YDR427W 1182 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SLD5YDR489W 885 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 GTR2YGR163W 1026 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YBR013CYBR013C 390 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 IRC13YOR235W 315 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 TFC8YPL007C 1767 nt1.31□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YIL102CYIL102C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YKL115CYKL115C 393 nt1.3□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SHE2YKL130C 741 nt1.3□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SBE22YHR103W 2559 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SFB2YNL049C 2631 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 CHS1YNL192W 3396 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 NUP192YJL039C 5052 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 GIC2YDR309C 1152 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YEL010WYEL010W 351 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YGL069CYGL069C 465 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 NCE101YJL205C 162 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 MIX23YBL107C 591 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 GRE2YOL151W 1029 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YOR333CYOR333C 417 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YBR174CYBR174C 315 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 SRP1YNL189W 1629 nt1.29□□□□□ -2.2
CCS1P40202 YDR338CYDR338C 2088 nt1.28□□□□□ -2.2
CCS1P40202 CCH1YGR217W 6120 nt1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms