Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTPDP35247 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTPDP35247 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms