Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTF4P34130 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTF4P34130 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTF4P34130 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTF4P34130 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms