Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms