Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL9P32969 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL9P32969 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL9P32969 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL9P32969 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms