Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTX1P32242 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTX1P32242 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTX1P32242 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTX1P32242 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTX1P32242 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTX1P32242 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTX1P32242 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTX1P32242 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTX1P32242 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX1P32242 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms