Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA10P31260 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA10P31260 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms