Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP1P29466 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP1P29466 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP1P29466 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP1P29466 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP1P29466 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms