Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLD1P28340 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLD1P28340 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLD1P28340 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLD1P28340 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLD1P28340 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLD1P28340 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLD1P28340 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLD1P28340 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms