Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTFRP26992 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms