Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms