Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNE1P24864 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms