Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4BP23588 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4BP23588 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms