Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPREP23469 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPREP23469 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPREP23469 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPREP23469 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPREP23469 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPREP23469 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPREP23469 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPREP23469 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms