Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB1P23443 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms