Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD247P20963 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD247P20963 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD247P20963 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms