Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PVALBP20472 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PVALBP20472 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PVALBP20472 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PVALBP20472 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms