Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI3P19429 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms