Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN8P19075 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN8P19075 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms