Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF4P18085 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF4P18085 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF4P18085 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF4P18085 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms