Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCP1P17987 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCP1P17987 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCP1P17987 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCP1P17987 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms