Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF3P17036 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF3P17036 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms