Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCFC2P16383 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCFC2P16383 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms