Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM27P14373 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM27P14373 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms