Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT1P13805 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNT1P13805 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms