Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT13P13646 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT13P13646 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms