Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PF4V1P10720 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PF4V1P10720 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms