Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI4P10075 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GLI4P10075 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GLI4P10075 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GLI4P10075 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GLI4P10075 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI4P10075 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms