Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms