Protein–RNA interactions for Protein: P09914

IFIT1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT1P09914 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT1P09914 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT1P09914 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT1P09914 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT1P09914 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT1P09914 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIT1P09914 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms