Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms