Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HBE1P02100 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HBE1P02100 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HBE1P02100 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HBE1P02100 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HBE1P02100 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBE1P02100 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBE1P02100 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBE1P02100 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBE1P02100 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBE1P02100 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBE1P02100 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HBE1P02100 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms