Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZBED1O96006 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZBED1O96006 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms