Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAP29O95721 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP29O95721 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms