Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG12O94817 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG12O94817 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG12O94817 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATG12O94817 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATG12O94817 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATG12O94817 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms