Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM2O94769 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM2O94769 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM2O94769 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms