Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN15O75808 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN15O75808 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms