Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NBNO60934 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NBNO60934 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NBNO60934 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBNO60934 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBNO60934 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NBNO60934 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms