Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH6O60337 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms