Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLIN1O60240 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms