Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRNO43815 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRNO43815 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRNO43815 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRNO43815 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRNO43815 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRNO43815 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRNO43815 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRNO43815 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRNO43815 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRNO43815 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRNO43815 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRNO43815 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRNO43815 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRNO43815 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms