Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FOXO3O43524 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXO3O43524 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms