Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD8O14715 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD8O14715 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms