Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
I3L3M4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
I3L3M4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
I3L3M4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
I3L3M4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
I3L3M4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
I3L3M4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
I3L3M4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
I3L3M4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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